在系统运行速度方面，ShopEx如果不生成静态页面，则打开页面会比较慢。由于文件太大，运行时间一长，后台会变得非常缓慢。运行效率有所欠缺，这也许是ShopEx最大的缺点。
与ShopEx相比，ECShop由于使用了强大的缓存机制，其前台和后台在系统执行速度上更为快速。
HiShop网店系统如果刚在后台生成模板，第一次打开前台的时候速度会稍微有些延迟，因为需要第一次编译，之后的速度基本上就很快。
V5Shop采用了层技术和Ajax技术，结合微软.NET+MSSQL2005平台运行，在稳定性的同时，也提供了较高的系统运行效率，打开前后台的速度都很快。
搜索引擎是客户来源的重要渠道，除了买广告、关键词以外，这个方式是最节约成本的推广方式，因此网店系统的搜索引擎优化功能就显得很重要了。从SEO角度来说，商品标题自定义、关键词、伪静态等功能基本上四家网店系统都有，我们来具体看看他们的详细情况。
ShopEx作为国内网店系统行业的领头羊，在SEO方面拥有很强的优势。除了基本的Description和Keywords外，还特地添加了分类描述功能和商品描述功能;此外链接规划、内链规划、站外推广链接等进一步加强了ShopEx的搜索引擎友好度。然而美中不足的是ShopEx的文章系统只擅于单页面、单词或者少词的优化，而不适于多词组、纵深度的优化。
ECShop在搜索引擎优化方面中规中矩，并没有特别突出的特点。但是其商品推荐功能可以作为外链建设手段之一;而它所具有的强大的商品关联和文章管理系统，也是搜索引擎优化上的关键。唯一的缺点是有时候会生成垃圾URL页面。
HiShop在搜索引擎优化方面做得很出色，不仅可以设置店铺的描述和搜索关键字，而且支持自定义每个商品详细页面的标题、描述、关键字，使每件商品信息达到更好的展示效果，并让搜索引擎快速收录。
作为后起之秀，V5Shop基本上算是集众家之所长。它支持伪静态和纯静态化生成HTML文件，可以全站生成静态页面，拥有全面而细致的SEO优化系统，包含到每件商品的标题和URL链接。而且文章和商品双向关联，可以建立文章和商品之间的关联、商品和文章之间的关联，这点比较适合SEO优化和内链建设。此外还可以通过V5Shop强大的文章系统进行深度的SEO优化策略和长尾策略。
由于每个用户对网店系统都有不同的需求，所以通用的网店系统无法满足所有用户的要求，这时网店系统的二次开发和模板切换功能就显得很重要。我们来看一下四大网店系统在这些方面的表现。
ShopEx的小、提醒工具、后台生成静态页面的文件都是经过加密处理的，只支持前台开源，不利于用户的修改和二次开发。在功能扩展方面，由于ShopEx没有开源，做二次开发的爱好者也不多，所以如果要在ShopEx提供的功能之上想要增加一些功能就需要找ShopEx的技术支持了。但是ShopEx的模板很丰富，在网上也能找到很多，也可以定制。
ECShop完全支持开源，用户可以方便灵活地进行二次开发。它对Dreamweaver模板机制提供了完美的支持，可使用Dreamweaver制作和查看自己的模板。同时程序提供对模板显示内容控制，如可以在页面上灵活添加指定分类的商品，或指定品牌的商品等。此外ECShop还可随意调整广告的显示，而无需手动修改模板。
HiShop虽然是免费网店系统，但是没有开源。模板制作难度较大，而且数量也有待提高。从开源的角度来看在功能扩展方面有一定的性。
V5Shop由于之前不开源，在使用和二次开发方面显得不便;在开源之后，V5Shop提升了系统的灵活性，用户可以按照自己的需求方便地进行二次开发。在模板方面，V5Shop根据各行业的不同需求，推出了“企业营销型”和“网商B2C商城型”两大系列多种分类的模板，用户可以根据自己的实际需求选择合适的模板。
除了产品功能外，厂商提供的各种服务和帮助系统也是衡量一款网店系统是否好用的一个参考因素。例如，产品使用帮助手册是用户能不能快速地掌握这个产品的功能使用的关键，所以有没有一个精心编制的产品使用手册对于用户来说是很重要的。我们将四大网店系统厂商对网友提供的服务和帮助系统做一个简要的对比。
ShopEx提供了比较详细的在线帮助文档，包括图文教程和视频教程。论坛的人气很旺，用户在使用ShopEx过程中遇到的各种问题都可以来论坛反映并寻找解决方案。而ShopEx推出了服务行业方案，包括一站式建店解决方案、全网全程电子商务解决方案、最佳网络分销解决方案、为淘宝商家提供电子商务服务、为外贸企业提供电子商务服务和ShopEx 绿卡商业授权等，不同行业的用户都可以根据自己的实际需求选择对应的服务方案。
ECShop除了产品实物外，文档资料和帮助都较少，只提供了帮助文档，没有视频教程。但论坛有很多资源，用户在使用过程中碰到的问题都可以到论坛反馈。在服务方面，提供了ECShop直通车和EC企业级定制方案：
HiShop提供了帮助文档和视频教程，论坛人气也很旺。在服务方面，HiShop推出了一站式快速建店服务、网店个性定务和企业建店解决方案，适合有不同需求的用户选择：
V5Shop提供了模板教程、图文教程和视频教程，非常详细。同时提供快速建店服务、运营服务、推广服务和电子商务外包服务：
在对四大网店系统进行多方面的比较后，我们在最后根据各网店系统的不同功能和特色给出如何选择的。
ShopEx适合个人和有着较深Web基础的用户，同时它定位于业务量的商家客户。所以如果您喜欢修改系统或有着较大的业务量，推荐选择ShopEx。
ECShop适合刚开始运行网店的用户。如果淘宝等平台的网商想试一下自助建站，可以先尝试一下ECShop，毕竟ECShop在操作方面更简单。
HiShop适合批发站点和一些分销加盟类网站，由于它拥有批发+零售的模式优势，中小企业、批发加盟类网站和个人选择HiShop。
随着越来越多的个人和商家投入到电子商务大潮中来，网店专用型主机开始受到关注。华夏名网根据主流网店系统的主要特点和运行要求，推出了多款 网店专用型主机 ，以帮助用户快速建立自己的网店。这些网店专用主机针对网上商店图片较多、对访问速度和稳定要求较高的特点，进行了特别优化，可以一键安装最新版的网店程序，完美支持ShopEx、ECShop、HiShop、V5Shop、Lodoeshop、Magento、Zen-Cart和osCommerce等多种网店程序：
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